根的生長發育是植物生長的重要特點，并影響陸地生態系統和生物地球化學循環過程。觀察根系的形態特征對于了解植物在自然生態系統中的表現，以及解釋陸地生態系統的水分、碳和營養物質的動態遷移過程有著重要的作用。以往，對于植物根系形態特征的分析多是由人工測量，而現在隨著科學技術的不斷進步，工作人員可直接使用植物根系分析系統來實現根系形態指標的自動分析。
植物根系分析系統可檢驗根尖數、根系長度、平均直徑、投影面積、表面積、體積、數量、連接數、長度、各級側根的長度總和、平均直徑、各級側根的表面積總和、體積總和、投影面積總和等，可進行大批量分析，打開多張根系圖片，可自動進行分析相關數據，可手工校正分析結果，保證檢測數據的準確性。
在生活實踐上，通過采取有效的技術措施能夠培養出來健壯、適合的地下系統，從而以促進地上部健壯生長，可以為實現作物高產、優良奠定堅實基礎。而整個過程需要研究根總長、根平均直徑、根面積、根尖計數等重要的研究信息，在過去都需要人工進行，誤差也在所難免。而根系掃描儀卻可將這些困難都解決，只需要將植物根系洗干凈，就能利用該儀器進行掃描分析。
運用植物根系分析系統掌握綠色植物根系構造，更容易掌握植物根系吸收水分、養分特性，從而為不同類型的農田、草地林地等選擇適宜的灌水時期和灌水方式提供可靠的數據參考，以此提升水分利用率，實現節水灌溉。
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